报告题目: DNA自组装及其生物传感应用
报告人:晁洁研究员
材料科学与工程学院（信息材料与纳米技术研究院）
南京邮电大学
Email:iamjchao@njupt.edu.cn
时间：2020年11月10号（周二）下午15 : 30
地点：仙林校区化学楼蒋雯若报告厅（H-201）
邀请人：叶德举
报告摘要：单核苷酸多态性（SNP）检测是化学测量学领域研究的热点和难点。研究表明，SNP与人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等都有非常紧密的联系。近年来发展的基于荧光分子探针的SNP直读技术为SNP 领域提供了新思路，然而由于单分子荧光寿命不稳定，以及近距离荧光信号难以分辨等原因，未能得到推广。鉴于此，我们利用DNA纳米技术，设计了一套基于原子力显微镜的成像探针；基于不对称PCR、磷酸外切酶以及可控延伸技术，实现双嵌段DNA分子对SNP的精准识别；通过DNA成像探针与双嵌段DNA分子的特异性结合，实现其对基因组SNP位点的准确标记及辅助原子力检测基因组DNA的SNP。该方法操作简便、耗时较短且花费较低，有望用于高危群体的发现、疾病相关基因的鉴定、药物的设计和测试以及生物学的基础研究等。
个人简介：晁洁，研究员，博士生导师，国家优秀青年基金获得者（2019）。主要从事DNA纳米技术与生物传感方面的教学和研究工作。作为项目主持人承担了国家自然科学基金委优秀青年科学基金、面上基金、江苏省杰出青年基金等10余项应用基础项目。围绕单分子基因分析这一研究主题，开展了系统性工作。开发了DNA自组装结构的设计原理和组装方法，发展了新型化学自组装体系；研制了DNA分子介导的多功能智能纳米探针；提出DNA结构探针识别与检测新策略，发展了单碱基识别系统，实现了复杂体系单分子水平的基因分析。
近年代表性文章：
(1) Chao Jie#, Wang Jianbang#, Wang Fei#, Ouyang Xiangyuan#, Kopperger Enzo, Liu Huajie*, Li Qian, Shi Jiye, Wang Lihua, Hu Jun, Wang Lianhui, Huang Wei, Simmel Friedrich C.*, Fan Chunhai*. Solving mazes with single-molecule DNA navigators. Nature Materials, 2019, 18, 273-279.
(2) Chao Jie#, Zhang Honglu#, Xing Yikang, Li Qian, Liu Huajie, Wang Lihua, Wang Lianhui*, Fan Chunhai*. Programming DNA origami assembly for shape-resolved nanomechanical imaging labels. Nature Protocols, 2018, 13(7), 1569-1585.
(3) Zhang Honglu#, Chao Jie*, Pan Dun, Liu Huajie, Qiang Yu, Liu Ke, Cui Chengjun, Chen Jianhua, Huang Qing, Hu Jun, Wang Lianhui, Huang Wei, Shi Yongyong*, Fan Chunhai*. DNA origami-based shape IDs for single-molecule nanomechanical genotyping. Nature Communications, 2017, 8, 14738.
(4) Zhang Yinan#, Chao Jie#, Liu Huajie*, Wang Fei, Su Shao, Liu Bing, Zhang Lan, Shi Jiye, Wang Lihua, Huang Wei, Wang Lianhui*, Fan Chunhai*. Transfer of Two-Dimensional Oligonucleotide Patterns onto Stereocontrolled Plasmonic Nanostructures through DNA-Origami-Based Nanoimprinting Lithography. Angewandte Chemie-International Edition, 2016, 55(28), 8036-8040.
(5) Wang Jianbang#, Chao Jie#, Liu Huajie*, Su Shao, Wang Lianhui, Huang Wei, Willner Itamar, Fan Chunhai. Clamped Hybridization Chain Reactions for the Self-Assembly of Patterned DNA Hydrogels. Angewandte Chemie-International Edition, 2017, 56(8), 2171-2175.
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